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Registro Completo
Biblioteca(s):  Epagri-Sede.
Data corrente:  03/06/2020
Data da última atualização:  03/06/2020
Tipo da produção científica:  Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Autoria:  ROSSAROLLA, M. D.; TOMAZETTI, T. C.; VIEIRA, L. N.; GUERRA, M. P.; KLABUNDE, G. H. F.; SCHERER, R. F.; PESCADOR, R.; NODARI, R. O.
Título:  Identification and characterization of SSR markers of Guadua chacoensis (Rojas) Londoño & P.M. Peterson and transferability to other bamboo species.
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  3 Biotech, Suíça, v. 10, p. 1-9, 2020.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The aim of this study was to develop simple sequence repeat (SSR) markers for genetic studies on G. chacoensis, as well as to evaluate their transferability to other bamboo species. Genomic DNA was isolated from G. chacoensis and its partial sequencing was used to find SSR loci. The obtained sequencing data were de novo assembled using the software CLC Genomics Workbench ® 8.0v. The SSR loci primers were identified and designed with the software SSRLocator. The selected markers were validated using 56 plants sampled in seven populations from southern Brazil. The markers with potential polymorphism were selected and fluorescently labeled for characterization by capillary electrophoresis. In total, 92 SSR loci were found in G. chacoensis contigs. Suitable primers were designed for 70 SSR loci, and the remaining 22 SSR loci did not have sequences for primer development. Out of 35 selected SSR markers, after PCR optimization, 10 with high polymorphism potential were characterized. These loci can be used in genetic analyses of G. chacoensis and all of them were successfully transferred to other bamboo species. Non-polymorphic loci require further tests with additional plants, from different populations, to identify possibilities of their use.
Palavras-Chave:  Genetic diversity; Genetic population; Molecular markers; Polymorphism; Primer design; SSR.
Categoria do assunto:  K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Epagri-Sede (Epagri-Sede)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
Epagri-Sede104685 - 1UPCAP - DD

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Ordenar por: RelevânciaAutorTítuloAno
Registros recuperados : 7
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1.Imagem marcado/desmarcadoMALOHLAVA, I. T. C.; TOMAZETTI, T. C.; ROSSAROLLA, M. D.; VOLTOLINI, A.; BÓ, M. A. D. Identificação de vírus utilizando técnica RT-qPCR em arranjo multiplex de amostras de videira em Santa Catarina. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro. Anais... Juazeiro: SBF, 2019. p. 50-53.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Epagri-Sede.
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2.Imagem marcado/desmarcadoWELTER, J. F.; FELIPPETO, J.; HAAS, I. C. S.; TOMAZETTI, T. C.; WELTER, L. J.; SILVA, A. L. Análises fenólicas dos vinhos das variedades 'Merlot' e 'Cabernet Sauvignon' nas regiões de altitude de Santa Catarina. Revista Congrega Urcamp, Bagé, p. 535-544, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
Biblioteca(s): Epagri-Sede.
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3.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, A.; ROSSAROLLA, M. D.; TOMAZETTI, T. C.; LIBERATO, V. C.; BRIGHENTI, A. F.; WELTER, L. J.; SILVA, A. L. Modelos para a estimativa de área foliar para a videira 'Helios' cultivada em São Joaquim-SC. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE FRUTICULTURA DE CLIMA TEMPERADO, 15., 2017, Fraiburgo. Resumos... Caçador: Epagri, 2017. p. 82
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Epagri-Sede.
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4.Imagem marcado/desmarcadoFREITAS, F. R.; TOMAZETTI, T. C.; PASA, M. S.; MARTIN, M. S.; RUFATO, L.; BRIGHENTI, A. F. MODELOS MATEMÁTICOS PARA A ESTIMATIVA DOS ÍNDICES DE MATURAÇÃO DA MAÇÃ ATRAVÉS DE MÉTODO NÃO DESTRUTIVO. In: SEMINÁRIO NACIONAL SOBRE FRUTICULTURA DE CLIMA TEMPERADO, 14., 2020, São Joaquim. Resumos... Florianópolis: Epagri, 2020. p. 80
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Epagri-Sede.
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5.Imagem marcado/desmarcadoROSSAROLLA, M. D.; TOMAZETTI, T. C.; VIEIRA, L. N.; GUERRA, M. P.; KLABUNDE, G. H. F.; SCHERER, R. F.; PESCADOR, R.; NODARI, R. O. Identification and characterization of SSR markers of Guadua chacoensis (Rojas) Londoño & P.M. Peterson and transferability to other bamboo species. 3 Biotech, Suíça, v. 10, p. 1-9, 2020.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Epagri-Sede.
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6.Imagem marcado/desmarcadoFREITAS, F. R.; BRIGHENTI, A. F.; COUTINHO, M. D. C.; VOLTOLINI, J. A.; MALOHLAVA, I. T. C.; TOMAZETTI, T. C.; LONE, A. B. Efeito de extrato de algas no enraizamento de estaca de pitaia. Agropecuária Catarinense, Florianópolis, v. 34, n. 2, p. 34-36, 2021.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
Biblioteca(s): Epagri-Sede.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSTEFANINI, M.; TOMAZETTI, T.; ROSSAROLLA, M.; COSTA, A.; BRUNA, E. D.; MALINOVSKI, L.; NODARI, R. O.; SILVA, A. L.; GUERRA, M. P. Phenology and thermal requirements of disease-resistant genotypes (PIWI) grown in the Goethe Grape Valley region of Brazil. Acta Horticulturae, Leuven , Belgium, n. 1248, p. 141-148, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - B
Biblioteca(s): Epagri-Sede.
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